本实用新型公开了一种牡丹种子筛选装置,包括筛选箱、电动推杆、风干箱和风机,所述筛选箱的顶端固定设置有入料口,且筛选箱顶端的一侧固定设置有注水口,所述筛选箱的一侧设置有活动轴,且活动轴的底端固定连接有挡板,所述筛选箱外部一侧的顶端安装有第一电机,且第一电机的一侧活动连接有螺旋轴,所述筛选箱底端的一侧活动连接有电动推杆。本实用新型通过控制面板启动第一电机可以带动螺旋轴进行旋转,同时螺旋轴外部一侧活动有滑块,则滑块可以带动中间位置的第一固定块进行移动,并且第一固定块底端固定连接有第二固定块,第二固定块的底端设置有筛选刷,通过第二固定块带动筛选刷移动可以对水面的坏种进行推动清理。