本发明公开了一种降低植物油中塑化剂的方法,包括以下步骤:对分子蒸馏系统供给循环水、冷冻水、热水及导热油;开启温度控制,预设进料温度;当导热油升至一定温度时,启动真空泵;待系统真空度达到0.1 Pa后,设定蒸馏温度、刮膜转速,进行油脂的脱塑化剂处理;开启进料阀,启动进料泵,将待处理的植物油导入分子蒸馏系统中,调节泵后调节阀控制进料速率,启动出料泵,得到处理后的植物油。本发明通过对分子蒸馏系统的调节,完成对植物油中重点控制指标的PAEs的高效脱除。