本发明提供一种茶树专用兔粪复混基肥的制备方法和应用,所述制备方法包括:将兔粪和农作物副产物混合均匀后进行堆肥发酵,获得发酵基质;将发酵基质和无机肥料混合均匀后即得。将获得的复混基肥用于茶树种植土壤改良,具体方法包括:施肥量按照每亩茶园0.5~3吨的量施用,施用前在两行茶树之间开条状沟,沟深15~25厘米,宽度10~15厘米,将上述茶树专用兔粪复混基肥均匀撒在条状沟内,并用土覆盖。本发明的复混基肥将兔粪和农作物副产物搭配使用,有效解决了种养过程中废弃物处理的难题。并且将兔粪和农作物副产物混合进行堆肥发酵,可杀灭原料中的病原菌和杂草种子,将有机物由不稳定状态转变为稳定的腐殖质,可以有效改良土壤。